بیشترین کاربرد فسیل ها در تعیین سن طبقات و بنابراین در بیوستراتیگرافی است . تمامی فسیل ها قادر به تعیین سن نسبی دقیق نیستند و برخی از آنها در تمام ادوار زمین شناسی وجود داشته اند .

به طور کلی می توان اقسام فسیلها را به شرح زیر خلاصه کرد :

1- فسیلهای شاخص ( Index – fossils ) : که دارای گسترش جغرافیایی وسیع بوده ولی در زمان کوتاه زمین شناسی می زیسته اند مانند فسیل آمونیت که منحصراً در کرتاسه میانی وجود داشته است .

2- فسیل های غیر شاخص ( Non Index – fossils ) : که تقریباً در تمام دوره ها و یا دورانهای زمین شناسی وجود داشته اند و شاخص زمان معین و کوتاه زمین شناسی نیستند . مانند برخی دوکفه ای ها ، شکم پایان ، مرجانها و ...